科研经费是指泛指各种用于发展科学技术事业而支出的费用。科研经费通常由政府，企业，民间组织，基金会等通过委托方式或者对申请报告的筛选来分配，用于解决特定的科学和技术问题。科学技术是第一生产力，大多数国家都非常重视对科研的经费投入，科研经费占国家或者地区GDP的比重可以反映一个国家或者地区对科研的重视程度。

　　科研经费的管理只是从财务管理这个单一方面进行的，科研单位财务部门就不同科研经费来源的经费归集起来进行统一管理，但是由于科研经费的不同来源导致其相关制度存在很大差异，因此便无法从科研经费使用的合理性和效益性进行控制。纵向科研经费实行预算管理，执行国家相关经费管理办法，严格按照项目主管部门批复的预算范围和开支比例规范使用科研经费。横向科研经费实行合同管理，必须按照项目合同书中约定的经费使用用途、范围和开支标准，执行国家和学校相关办法，合理、规范使用科研经费。科研经费预算经批准后一般不作调整。支出预算中的劳务费、专家咨询费和管理费预算不予调整，其他支出科目在不超过该科目核定预算10%或超过10%但调整金额不超过5万元的，经科研财务管理科审核确认，可以根据项目研究需要调整执行。确因项目研究目标、重大技术或主要研究内容调整而必须对项目经费预算进行调整，超过上述控制范围的，由项目负责人提出调整意见，经科研财务管理科审核后，按程序报主管部门批准。

　　同时，国家尚未出台针对科研管理监督地审计规定，很多科研单位对科研经费利用监督不佳，科研单位审计部并未充分起到其在科研经费使用的事前、事中、事后的精度审计的职能，而只是针对科研结题完成后才开展审计工作。同时，与外部审计相比，科研单位的内部审计部门，存在着审计人员缺少、专业能力差、独立性受本单位影响等固有局限，从而使得科研经费使用情况的审计是否反映真实情况便很难保证。因此，对于科研经费使用过程中存在的漏洞无法及时发现和应对，经费管理制度地执行不力，科研经费便无法有效使用，同时科研腐败也便无法有效地遏制和杜绝。

　　1．科研经费来源的多元化造成了管理与核算的复杂性随着科研体制改革、科研经费管理制度推进和变化，科研单位经费也不再仅限于某一单一渠道。就目前而言，当前，我国科技项目经费，主要来自科技部、国家自然科学基金委，此外还有国家发改委、教育部、农业部等其它的部委。有两个主要的研究经费，纵向科研经费，主要由各级政府部门和有关基金会发布，另一种是横向科研经费，是社会其他部门提供资金。不同的经费来源给科研单位对于经费的管理过程中的预算、支出和财务决算提出了不同的要求。

　　2．科研经费的管理办法多但条款设置不合理，经费使用信息失真科研经费来源的多元化，造成了现在科研经费管理办法多种多样的现状。然而经费管理办法中也相应存在一些并不不合理的条例，在某种程度上打击了科研工作者全心全意进行科研工作的热情。就我国目前纵向科研经费管理规定而言，课题组的科研人员不能从课题费中列支劳务费或只许列支少量劳务费。

　　3．科研经费管理缺少完善的财务管理和审计监督机制科研经费在使用过程中存在的一些问题，对科研单位制度不完善，制度的执行不严格等，缺乏财政部负责与科研部门和项目平台和信息共享。内部控制制度的研究单位是不完美的，国家也对内部控制制度的要求相关的规范和制度缺失。

　　4．缺少有效的绩效评价机制科研项目结题完结后，往往只是关注经费预算与决算的相符程度，而并不太关注经费使用的绩效情况，导致一些编制虚假经济事项套取经费的现象。就科研经费绩效审计视角来看，目前对于科研经费管理和审计缺乏整个过程系统管理的管理。

　　1．统一经费管理的制度，健全的科研经费管理体制科研单位的相关部门应该对症下药，针对本科研单位科研经费实际使用过程中存在的一些漏洞和问题，结合国家相关规定及科研经费的不同特点，建立科学、合理、规范的经费管理体制，并且在遵守管理办法的基础上，根据本单位的具体情况制定与之相适应的管理办法。财务部门、科研管理部门、资产管理部门及审计部门和课题组要形成职责明确、分工合作、相互配合的科学工作机制。 　　 　　2．树立科研经费成本核算意识，加强科研经费财务管理要重视对科研经费收入的审计并加强监督管理，保证不同来源的科研经费收入归于财务部门进行集中管理核算；要从根本上防范和消除科研经费脱离监管而不当使用，形成体外循环。

　　3．强化科研经费使用情况的管理和监督，加大科研经费审计力度和范围科研经费的预算应当满足课题研究的现实需要，要建立财务部门和科研部门之间沟通交流和信息共享的平台，保证科研经费使用和监督的顺利进行。科研审计部门对于科研项目要不定期地审计和监督，而对于科研经费则要采取定期检查和抽查其使用情况，评估使用效果。

　　4．建立有效的科研经费使用绩效评价体系在进行科研项目的审批中，都会评估该科研项目预计的经济效益和能够产生的成果。那么，科研经费地投入能否产生对社会有益的成果和效益是衡量科研项目的重要依据之一。因此要建立有效的绩效指标评价体系。同时，绩效考核不能弹出通过财务指标和经济指标予以评价，还应当利用一些非财务指标进行综合考核，全面判断科研经费的使用绩效。