科技资源配置是指科技资源在全部科技活动中的不同活动主体、学科领域、时空的分配与组合。科技资源配置包括微观、中观和宏观层次。微观层次是指具体的某一科技创新主体如何在其内部匹配(组合)各种科技资源，以便高效率地产出科技成果。中观层次即部门层次和地区层次。最高层次是宏观层次，是指国家调控管理职能部门对金社会的科技资源在不同科技活动主体、不同科技活动过程、不同学科领域、不同地区、不同部门、不同行业之间的分配。

　　科技资源配置的要素是科技资源配置的投人系统和接受系统。主要有科技活动主体、科技活动实施(主要是科技计划的实施)以及科技学科门类领域、产业行业部门、时间与区域的分布等。因此，科技资源配置就是科技资源在上述各要素中的分配与组合。

　　各要素中科技活动主体是主导性的要素，又可分为调控管理主体和实施执行主体。调控管理主体是各级科技活动上级管理部门;实施执行主体是科技活动的基层实施执行者(企业/高校/研发机构/项目负责人)。前者主要是分配科技资源(宏观配置)，将科技资源按一定的规模、结构、强度配置到科技活动执行者或领域(行业);后者主要是组合科技资源(微观配置)，科技资源接受方对科技资源，优化配置于执行体。分配科技资源与组合科技资源，要遵循市场对资源配置起基础性作用的规律、科技活动自身的规律以及发挥政府调控和社会监督作用。科技资源配置主要是存在于科技资源配置全过程的分配与组合的矛盾双方，分配经常居于矛盾运动的主要方面，宏观管理部门要重视调查研究，完善科技资源优化配置。

　　科技资源配置的运行方式是科技资源由分配达到组合的运行模式。主要分为市场配置、政府配置、复合配置。

　　市场配置是市场作为科技资源配置的基础，由市场的需求主体配置科技资源。如企业按市场需求投人科技资源，又如创业投资(风险投资)、外资企业、国内外研发机构的科技资源投人等，都属于市场配置。

　　政府配置是政府按建设创新型国家，通过国家规划和计划配置科技资源。政府配置的国家科技计划主要是指令性计划，以政府为主导，为国家科技发展和国家科技发展布局，加强科技发展的前瞻性、前沿性、综合性，按照国家目标配置科技资源。

　　复合配置是多元配置科技资源。包括政府计划与市场需求的复合配置、政府不同管理部门科技资源的复合配置等。国家指导性科技计划，如星火计划、火炬计划、科技成果重点推广计划，它们都是以市场为导向的国家指导性科技计划，科技资源就是复合配置。还有一类复合配置是政府不同管理部门的科技资源配置。不同管理部门的科技资源，在科技活动中执行主体重组。如“985工程”、“211工程”，高校与相关科技计划的科技资源进行配置重组;如企业技术创新与地区振兴计划的科技资源进行配置重组;如产学研合作三个主体的科技资源进行配置重组。

　　科技资源配置的运行方式不同，为科技资源配置提供了重组空间。重组配置创造了资源优化配置的条件，最大限度地利用了全社会科技资源，提高投人产出比。