并购整合成本是指并购后使被并购企业健康发展而需要支付的长期营运成本。

1．整合改制成本

取得对被并购企业的控制权后，必然需要对被并购企业进行重组或整合，小则调整人事结构，改善经营方式；大则整合经营战略和产业结构，重建销售网络。为此需要支付派遣人员、建立新的领导班子、安置原有领导班子、安置富余人员、剥离非经营性资产、淘汰无效设备、进行人员培训等有关费用。

2．注入资金成本

并购企业要向被并购企业注入优质资产，拨人启动资金，为被并购企业打开市场增加市场调研费、广告费和网点建设费等。