工商行政管理机关是国务院领导下的经济行政管理机关。在中央，它是国务院的直属机关；在省、自治区、直辖市，它是省、自治区、直辖市人民政府直属的职能机构。省、自治区、直辖市以下的工商行政管理机构由省、自治区、直辖市工商行政管理局实行垂直领导。

我国工商行政管理机关是由纵向结构组织系统和横向结构组织系统两个方面构成的有机整体。纵向结构组织系统包括四个层次：

第一层次是国家工商行政管理总局。

第二层次是管理协调层，即各省、自治区 、直辖市的工商行政管理局。

第三层次是监督执行层，即市、县级工商行政管理局。

第四层次是具体执行层，包括工商行政管理分局和县工商行政管理局和县工商行政管理局下属的按经济区域设在乡镇的工商行政管理所。

横向结构组织系统是指按业务功能和管理活动对象分工所设立的职能机构及其相互关系。包括对外职能管理和机关内部管理两方面的机构。